С 2005 до 2009 года она возглавляла Большую коалицию с Христианским социальным союзом (ХСС) и Социал-демократической партией Германии (СДПГ), сформированную после федеральных выборов 22 ноября 2005 года. На выборах 27 сентября 2009 года ее партия ХДС набрала наибольшее количество голосов, и она сформировала коалиционное правительство с ХСС и Свободной Демократической партией (СДП). 28 октября 2009 года ее правительство было приведено к присяге.

В 2007 году Меркель стала также президентом Европейского совета и возглавила Большую Восьмерку. Она играла центральную роль на переговорах о Лиссабонском договоре и Берлинской Декларации. Во внутренней политике реформа здравоохранения и решение проблем будущего энергетического развития на данный момент являются главными сферами ее деятельности.

Меркель является первым канцлером-женщиной в Германии. С 2006 по 2009 годы журнал "Форбс" называл ее самой могущественной женщиной в мире. В 2007-ом она стала второй женщиной, возглавившей Большую восьмерку после Маргарет Тэтчер.

Канцлер Меркель - член совета женщин - мировых лидеров, Международной организации нынешних и бывших президентов женщин и премьер-министров.

В 2008 году Меркель приняла награду Карла Великого за ее "работу по преобразованию Европейского союза". Приз был получен из рук Николя Саркози.